http://www.nvidia.cn/object/gpu-acceleration-genomics-application-openacc-press-20120806-cn.html
"DNADist" 軟件輕松實現 16 倍速度提升， 可幫助 Roche 和其它醫藥公司加快藥物研究
2012 年 8 月 6 日 — 中國上海 — 英偉達公司今天宣布，OpenACC 編程標準讓中國研究人員能夠大幅加速 DNADist 基因組應用程序(1)，研究人員在尋找遺傳疾病治療方法的初期階段使用該應用程序，這些遺傳疾病包括唐氏綜合癥、血友病、囊胞性纖維癥以及鐮狀細胞疾病等等。
利用 CAPS 公司 OpenACC 編譯器，上海交通大學和 CAPS公司 研究人員僅僅通過在應用程序代碼中增加了四個簡單的提示，即所謂的“指令”，便在一臺英偉達™ (NVIDIA®) Tesla™GPU 系統上令 DNADist 應用程序加速了 16 倍。
DNADist 是一款距離矩陣應用程序，用于研究進化史上各個物種之間的遺傳關系，該應用程序讓研究人員能夠讀取核甘酸序列，進而從定序的 DNA 數據中提取信息，此舉有可能讓人們能夠更好地了解遺傳流行疾病的原因和治療方法。加速 DNADist 應用程序讓研究人員能夠大幅擴大研究輸入數據的范圍、在疾病治療研究過程中更早地獲得可付諸實際行動的信息。
OpenACC 是一種利用指令的并行計算編程標準，該標準旨在讓全球數以百萬計的研究人員能夠輕松利用 GPU 計算的強大能力。 它為用戶提供了最簡單的方式，無論用戶是否具備大量并行編程專業技術，均可在數小時之內運用自己熟悉的編程模型來加速研究工作。
OpenACC 和 GPU 加速的威力讓 Roche 驚嘆不已
只需極少的工作即可迅速可實現改變行業面貌的應用程序加速，OpenACC 讓 Roche 這樣全球領先的醫藥公司能夠以更具性價比的方式更快地研究、找出和開發出更有效的藥物。
Roche 醫藥全球信息項目總監 Steve Pan 表示：“OpenACC 能夠如此迅速而輕松地為 DNADist 釋放 GPU 加速能力，這讓我感到震驚。DNADist 是我們頂級關鍵的應用程序之一。 GPU 的潛在影響是無法估價的，因為只要我們的產品能夠更快地上市，即便僅僅是提前一天，也會拯救更多生命。”
英偉達 Tesla 事業部高級總監 Sumit Gupta 指出：“想要從浩繁的可用 DNA 定序數據中提取有意義的信息，需要依賴不斷增長的計算能力。 OpenACC 讓研究人員能夠快速而輕松地利用 GPU 加速器的巨大性能，來分析海量的基因數據。這樣能夠大幅縮短研究生物系統所需的時間，有可能會讓研究人員開發出更有效的下一代藥物。”
目前有大量研究人員和工程師正在運用支持 OpenACC 的編譯器和 CPU/GPU 混合型計算系統來加速各類應用程序，而且研究人員和工程師數量仍在不斷增長。涉及的應用程序包括 CAD/CAM、圖像處理、材料科學、分子動力學以及量子化學等等。 在很多情況下，用戶報告，僅僅用了短短幾個小時的時間，便已實現高達 5-10 倍甚至更高的速度提升。
展示 OpenACC 和 DNADist 的網絡研討會 – 2012 年 9 月 6 日
CAPS 公司將于 2012 年 9 月 6 日星期四開辦一場免費的公開網絡研討會，為參與者講解 OpenACC 使用案例和最佳實踐，詳細介紹 DNADist 應用程序的加速。如需了解更多信息或如需報名參加，敬請訪問 https://www2.gotomeeting.com/register/668751466。
關于英偉達™ Tesla™ GPU
英偉達™ Tesla™ GPU 是基于英偉達™ (NVIDIA®) CUDA™ 并行計算平臺的大規模并行加速器。 英偉達™ Tesla™ GPU 完全專為節能的高性能計算 (HPC)、計算科學以及超級計算而設計，與僅使用 CPU 的做法相比，能夠大幅加速一系列科學與商業應用程序。
如需了解有關英偉達™ Tesla™ GPU 的更多信息，敬請訪問英偉達™ Tesla™ 網站。 如需了解英偉達 CUDA 的更多信息或如需下載最新版本，敬請訪問 CUDA 網站。如需查看更多英偉達新聞、公司和產品信息、視頻、圖像以及其它信息，敬請訪問英偉達新聞中心。
關于英偉達公司
1999 年，英偉達公司 (納斯達克代碼: NVDA) 發明了圖形處理器 (GPU)，讓全世界重新認識了計算機圖形的威力。現在，從智能手機到超級計算機，英偉達的處理器已廣泛應用于各種各樣的產品。手機、平板電腦以及汽車信息娛樂系統均采用英偉達的移動處理器。PC 游戲玩家利用 GPU 來享受令人嘆為觀止、身臨其境的游戲世界。專業人士利用 GPU 來打造 3D 圖形和電影中的視覺特效、設計包括高爾夫球棒與大型噴氣式客機在內的各種解決方案。研究人員利用 GPU 所實現的高性能計算 來推動科學技術進步。英偉達公司擁有 5,000 多項已發布、已批準或已備案專利，其中涵蓋了關乎現代計算之根本的諸多理念。如需了解更多信息，敬請訪問 www.nvidia.cn。
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1 DNADist 是 Phylip (PHYLogeny Inference Package) 開源軟件包的一部分，這些軟件程序為生物科學領域 (主要是種系發生學科) 的學術人員所采用。 來源: http://en.wikipedia.org/wiki/PHYLIP
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