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A Za, A Za, Fighting...

堅信:勤能補拙

PKU 1007 DNA Sorting/2299 Ultra-QuickSort

問題:
http://acm.pku.edu.cn/JudgeOnline/problem?id=1007
http://acm.pku.edu.cn/JudgeOnline/problem?id=2299

思路:
求逆序對的個數
這兩題的基本問題是一致的,給定一個數組(包括字符串),求出逆序對的個數

1. 最簡單的方法
兩層循環,復雜度O(n^2)
 1 int
 2 inversion_cal(char *str)
 3 {
 4     int i, j, count = 0;
 5     int len = strlen(str);
 6     for(i=0; i<len; i++)
 7         for(j=i+1; j<len; j++)
 8             if(str[i] > str[j])
 9                 ++count;
10     return count;
11 }

2. 歸并排序&分治思想
其實,只要將歸并排序稍加修改,就是一個求解逆序對個數問題的O(nlgn)方法
要理解的是這其中涉及的分治思想(三步驟):
a. 分解為子問題
b. 求解子問題
c. 合并子問題的解來得到原問題的解
具體對應到求逆序對個數的問題:
a. 將原數組分解為前后兩個子數組
b. 求解子數組的逆序對個數
c. 合并前后子數組,同時計算逆序對個數(這個是指逆序對的第一個數在前子數組中,而第二個數在后子數組中)

 1 long long
 2 merge_count(long *arr, long *temp, long begin, long end)
 3 {
 4     if(begin >= end)
 5         return 0;
 6     long i, j, k, mid = (begin+end)/2;
 7     long long rt = 0;
 8     rt += merge_count(arr, temp, begin, mid);
 9     rt += merge_count(arr, temp, mid+1, end);
10     i = k = begin;
11     j = mid+1;
12     while(i<=mid && j<=end) {
13         if(arr[i] <= arr[j])
14             temp[k++= arr[i++];
15         else {
16             temp[k++= arr[j++];
17             rt += (mid-i+1);
18         }
19     }
20     for( ; i<=mid; i++)
21         temp[k++= arr[i];
22     for( ; j<=end; j++) {
23         temp[k++= arr[j];
24         rt += (mid-i+1);
25     }
26     /* copy */
27     for(k=begin; k<=end; k++)
28         arr[k] = temp[k];
29     return rt;
30 }

3. 特例方法
針對PKU 1007該題的特殊性: 字符串中只包含A, G, T, C四個字母,還有一種更加簡單的O(n)方法

 1 int 
 2 inversion_cal2(char *str)
 3 {
 4     int i, temp[4], count = 0;
 5     int len = strlen(str);
 6     memset(temp, 0sizeof(temp));
 7     for(i=len-1; i>=0; i--) {
 8         switch(str[i]) {
 9             case 'A':
10                 ++temp[0];
11                 break;
12             case 'C':
13                 ++temp[1];
14                 count += temp[0];
15                 break;
16             case 'G':
17                 ++temp[2];
18                 count += (temp[0]+temp[1]);
19                 break;
20             case 'T':
21                 ++temp[3];
22                 count += (temp[0]+temp[1]+temp[2]);
23                 break;
24         }
25     }
26     return count;
27 }

posted on 2010-07-04 10:07 simplyzhao 閱讀(277) 評論(0)  編輯 收藏 引用 所屬分類: A_排序

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